Penilaian fontanel tidak menyebabkan komplikasi, terutama bila pemeriksaan hanya menggunakan teknik sederhana seperti pengukuran dimensi fontanel, palpasi, auskultasi, dan perkusi. Namun, bila dibutuhkan pemeriksaan lebih lanjut dengan computed tomography (CT) scan atau magnetic resonance imaging (MRI), akan dibutuhkan sedasi yang dapat memiliki efek samping seperti depresi pernapasan.[1,2]

Penilaian fontanel dengan teknik dasar seperti pengukuran dimensi, palpasi, auskultasi, dan perkusi dapat dilakukan dengan peralatan sederhana dan teknik yang mudah. Oleh karena itu, penilaian fontanel tidak memiliki komplikasi.