Kontraindikasi NIPT atau noninvasive prenatal testing adalah penggunaan sebagai uji diagnostik primer. Pada dasarnya, NIPT bersifat noninvasif terhadap janin, sehingga relatif aman dilakukan. Namun, skrining NIPT tidak boleh tidak digunakan sebagai uji diagnostik primer, karena masih ada kemungkinan hasil positif dan negatif palsu pada beberapa keadaan khusus, misalnya pada ibu dengan komorbiditas neoplastik.[6]

Penolakan Pasien

NIPT tidak boleh dilakukan tanpa persetujuan atau informed consent dari pasien untuk menghormati hak autonomi pasien. Sebelum pengambilan sampel darah, dokter perlu menyampaikan bahwa pasien mungkin akan merasa sedikit sakit pada area suntikan.[1,4]